La suite des aventures de Niwa, étudiant en première année d'architecture. Grâce à sa rencontre avec Mayuri, Niwa s'est découvert le pouvoir de voir les souvenirs des constructions. Tout en poursuivant assidument ses études et en explorant le passé des bâtiments, il commence à prendre conscience de la célébrité de son grand-père, un architecte de la région de Yokohama qui, avant sa mort, avait coupé les ponts avec sa famille.

Un jour, alors que Niwa visite une bibliothèque désaffectée sur le campus de son université, une vision lui révèle des taches de sang au pied d'un escalier. Qu'a-t-il bien pu se passer dans ces lieux ? Une rumeur raconte qu'il y a bien longtemps, la bibliothèque aurait été le théâtre d'un tragique accident. Les hasards mystérieux du destin qui lie Niwa à son grand-père vont refaire surface pour l'entraîner vers un monde insoupçonné…