L'affrontement contre le kabutomushi titan va s'achever… Mais « les exterminateurs », ce mystérieux groupe de mercenaires chasseurs d'insectes géants, a déjà commencé à agir dans l'ombre !! La paix de la ville d’Edo est menacée et des tensions commencent à apparaitre au sein même des hautes autorités de la cité…