Motoko et la famille de Kasukegawa passent leurs vacances d'été dans la région d'Hokkaidô. Après que Mikiri ait réussi à contrôler Zéro, tout ce petit monde se prépare pour la reprise des cours. Alors que se profile la grande fête du lycée, une nouvelle infirmière scolaire fait son apparition, ainsi qu'une jeune fille mystérieuse qui semble avoir un intérêt tout particulier pour Motoko…