Après avoir dérobé le Graal supérieur de Fuyuki à la fin de la Seconde Guerre mondiale, la famille Yggdmillennia se sépare 60 ans plus tard de l’Association des Mages. Leur rébellion devient alors l’origine d’une division entre 2 factions de Maîtres, invoquant chacun 7 esprits héroïques pour une guerre de front entre 14 Servants, le tout dirigé par Ruler, servant médiateur envoyé directement par le Saint-Graal… La faction des Noirs tente de mettre au point un plan pour éliminer définitivement Jack l'Éventreur et décide d'utiliser Sieg comme appât...