En 11941 ap. J.-C., le groupe YoRHa se rend sur Terre lors de l'opération "Pearl Harbor" afin de reprendre la planète aux formes de vie mécaniques qui l'ont envahie. Seuls quatre membres de l'escadron sont parvenus au sol. Bien qu'ils aient demandé l'annulation de la mission, le centre de commandement leur ordonne de poursuivre. Lors d'une bataille contre l'ennemi, des résistantes arrivées sur Terre il y a des centaines d'années leur viennent en aide. D'abord méfiantes envers les YoRHa, elles finissent par collaborer pour mener l'opération à bien, comprenant les problématiques de chacune.