Alors qu’Asuka et ses amis arrivent à Okinawa où a lieu leur classe de mer, l’unité M dirigée par le lieutenant-colonel Iizuka, Mia et Tamara ainsi que d’autres responsables militaires sont déjà sur place à la caserne militaire de Naha, dans le cadre du sommet commercial extra-dimensionnel. Mais Geese, accompagné d’une fille nommée Chisato devenue une Magical Girl, profite de cette occasion pour lancer une attaque surprise ! Quatre des Magical Five vont de nouveau unir leurs forces afin de faire face à l’Armée de Babel. Que leur réservera donc cet affrontement ?!