Seize ans ont passé depuis le terrible drame survenu au sein du Tokyo Spacetree. Arata est devenu un imminent chercheur au sein de l’Université des Colonies unies. Son objectif est clair : venir en aide aux daphnéens, pour allonger leur espérance de vie… Aveuglé par ses recherches, il ne voit pas que Tara s’impatiente et ne rêve que d’une chose : passer un nouveau contrat avec lui.