Grâce à ses nombreuses réussites médicales ainsi qu'à la diversité de ses relations, Jin Minakata se sort finalement de l'impasse dans laquelle il se trouvait et peut enfin retrouver son cabinet. Libéré des soupçons de placebo qui planaient sur lui, Jin se voit successivement invité à partir pour la France par Napoléon III, puis à devenir médecin de la cour par Ryôjun Matsumoto. Mais notre héros choisit finalement de se rendre à Kyôto avec les membres de son cabinet pour empêcher coûte que coûte, quitte à changer pour cela le cours de l'Histoire, l'assassinat de Ryôma.