Fin des années 1990, dix ans après la saison 3. Jotaro Kujo se rend dans la ville de Morioh à la recherche de son oncle, fils illégitime dun précédent Jojo. Au cours de son périple il se lie damitié avec un lycéen du nom de Josuke Higashikata qui savère être celui quil recherche. Jotaro va pouvoir le mettre en garde contre un manieur de Stand qui se cache dans sa ville.