Nagasaki est devenu un territoire des barbares du sud. Poussé par l'affaiblissement de l'école du bouddhisme de Jôdo Shinshû suite à la chute de l'Ishiyama Honganji, le missionnaire Valignano, qui ambitionne d'étendre l'influence du Christianisme dans ces terres japonaises, parvient à obtenir une audience avec Nobunaga…