Marin est un poisson-clown très protecteur envers son fils Nemo. Ils mènent tous deux une existence paisible le long de la barrière de corail australienne, jusqu’au jour où le petit Nemo est capturé par un plongeur ! Commence alors un grand périple pour son père à travers ce vaste océan qu’il redoute tant.

Avec l’aide de Dory, un poisson-chirurgien sympathique mais amnésique, Marin va remuer ciel et mer pour retrouver la trace de son fils, croisant sur sa route des personnages hauts en couleur !