Venu à Nagasaki pour y donner des cours sur la pénicilline, Jin y retrouve un Ryoma se démenant pour concrétiser l'alliance entre les clans Satsuma et Choshu, ainsi que le soldat du Choshu, Shusuké Higashi. Mais ce dernier qui s'interroge quant aux véritables motivations de ce projet d'alliance, pointe brusquement sa lame vers Ryoma ! Au contact de ces jeunes âmes s'efforçant d'ouvrir une nouvelle voie d'avenir dans cette époque tumultueuse de la fin du Shogunat, nombreuses sont les pensées qui vont et viennent dans le cœur de Jin !