Le passé de ces jeunes filles les mènera à une dure réalité.

Alors qu'Iroha recherche toujours sa sœur avec ses camarades, l'ancienne meilleure amie de Yachiyo, Mifuyu, vient les voir à la villa Mikazuki. Celle-ci faisant partie des Ailes des Magius, Iroha décide de lui parler pour résoudre leur différend. Mais elle ne s'attendait pas à découvrir la vérité sur le sort des Puella Magi…