Seule la mort est équitable…

Accusé d'un massacre qu'il n'a pas commis, Kôtarô Kudô est transféré dans l'institut de Kokuyô, qui regroupe uniquement de jeunes meurtriers impitoyables. Il tente alors de s'en échapper, afin de retourner auprès de sa petite sœur qui a une santé fragile. Grâce à l'aide de Shôko Utsurogi, une camarade de classe, il parvient presque à s'enfuir, mais c'était sans compter sur Aogiri, la terrible commandante en chef des gardiens, et son gros molosse, qui plongent Kôtarô dans une situation désespérée.

C'est alors que le jeune homme décide de se battre en jouant le tout pour le tout.

Mais il ignore qu'une ombre se trouve derrière lui…