Depuis qu'il a rencontré la source de contamination, Riku est déterminé à nourrir Neene de souvenir pour la faire grandir, malgré la menace qu'elle fait peser sur l'humanité. Mais plus elle grandit vite, et plus il doit la cacher au reste du monde. mais la vie n'est pas ainsi faite et il sait qu'un jour, tout s'écroulera. De son côté, Rena doit faire face à des souvenirs disparus, et un nouveaux manipulateur de jinki surgit du passé de Riku.