La bataille de Toba-Fushimi, grande guerre qui divisa le Japon du Bakumatsu, a débuté. Alors que Hijikata et ses compagnons s'apprêtent à rejoindre le combat, une nouvelle tragique vient bouleverser les rangs du Shinsen Gumi, poussant Isami Kondô et Sôji Okita à s'éloigner du front. Hijikata, devenu commandant remplaçant, se lance dans la lutte contre l'armée du nouveau gouvernement qui brandit la bannière impériale.