Setsuna Mudo est amoureux de sa sœur, Sara. Alors que leur mère fait tout pour les séparer, les deux héros osent enfin s’avouer leurs sentiments et s’enfuient pour vivre leur amour interdit. Pendant ce temps, le meilleur ami de Setsuna se fait arrêter à sa place pour le meurtre de Kato. Alors que les deux amants reviennent l’aider, une subalterne de Rosiel tente d’assassiner Sara ! Le choc provoque le réveil de l’ange organique Alexiel, qui sommeillait dans le corps de Setsuna, au moment où Dieu tente de détruire notre monde. Le jeune homme décide alors d’aller chercher l’âme de sa sœur dans l’Hadès. S’il réussit, il sauvera également notre monde...