Yamato, le cuirassé, très endommagé après la bataille menée contre le seigneur Desler de l'empire de Gamilas, a atteint la planète Isacandar et sauvé la Terre des radiations. Cet honorable sacrifice et cet exploit ont évité l'exinction de la vie et à permis à la Terre de se reconstruire rapidement, célébrant depuis la paix et la prospérité. Mais en Mai 2201, un danger plus grand encore menace la voie lactée : une gigantesque comète blanche se dirige vers la planète bleue. Arrive alors un message en provenance d'une planète située aux confins de l'espace, de la part d'une jeune fille mystérieuse prénommée Teresa… Le yamato doit reprendre la route…