Sasahara ne regrette pas d'être entré au Genshiken, le club d'étude de la culture visuelle moderne, tout particulièrement lorsque les membres se rendent à une convention pour dénicher de nouveaux fanzines. Il vit cette expérience avec beaucoup de plaisir jusqu'au jour où l'université décide de fermer le Genshiken, ainsi que d'autres clubs, en raison de leur manque d'activités officielles. Atterrés par cette cruelle nouvelle, les membres baissent vite les bras et se résignent à accepter cette situation. Mais à la surprise générale, Saki refuse ce coup du destin et s'engage dans un combat sans merci pour sauver le club.