Une sorcière, du nom d'Urasue, kidnappe Kagome, pour s'emparer de son âme et la transférer dans le corps de Kikyô, reconstitué à l'aide d'un sort. Ainsi ressuscitée, Kikyô fait des révélations sur ce qui s'est passé il y a 50 ans. On apprend qu'un monstre, du nom de Naraku, a manigancé une querelle entre Inu-yasha et Kikyô, afin de les voir s'entre-tuer.

Kagome, Inu-yasha et Shippô, rencontrent Miroku, un étrange bonze qui se joint à l'équipe pour partir à la recherche de Naraku.